農場前身為「台東大同合作農場」，隸屬國防部。於43年11月1日改隸於行政院國軍退除官兵輔導委員會， 45年9月1日改隸於台灣省政府社會處合作事業管理處， 51年7月1日回隸本會， 52年6月接受東部土地開發處之大南墾區後，分設知本、大南兩個輔導區， 53年8月1日輔導區制廢止，以大南墾區改設知本分場， 58年11月1日場銜改稱今名「台東農場」。61年東河分場成立， 72年長良分場成立， 85年配合政府產業東移觀光投資案，成立休閒農業區。89年7月配合農場組織精簡裁併鹿野、東河、長良3個分場，保留知本分場。農場轄管土地面積計2764餘公頃，範圍分佈臺東縣、市及花蓮縣9個鄉鎮。農場原以輔導安置退除役官兵從事農墾為主要任務，自90年起轉型為自給自足單位。
農場依土地條件從事農業生產經營，目前主要以水稻、瓜果、雜作及魚蝦鰻水產養殖委託經營為主，為提升農產品競爭力，正積極推動良質米生產履歷認證，並續朝有機栽培方向努力；少部份辦理蠶絲被、香米、桑椹等農產加工直營生產，東河休閒區及池上民宿觀光遊憩業務依促參法規定辦理委外經營。