鄧祖琳主任委員回憶起領導輔導會的期間，面臨最大挑戰是處理SARS疫情。92年的臺灣社會爆發嚴重的SARS病毒感染事件，人人岌岌可危，恐懼與日俱增，整個醫療體系也經歷重大的考驗。身為臺灣醫學重心的榮民醫療體系在深刻了解SARS的危害力後，即積極主動參與防治工作，立即構建隔離病房與安置病患的措施，基於社會參與的關懷，鄧主任委員更親自率領相關人員投入這場與病毒對抗的重要戰役。